1.特殊教育专业（师范）
以培养高素质的特殊教育教师与创新性临床实践管理者等人才为目标。该专业自1993年创办，具有悠久的办学历史，是全国最早开设特殊教育专业的院校之一，国家重点发展专业，首批国家级卓越特殊教育教师培养计划改革项目，重庆市一流专业，专业排名全国前列。
2.特殊教育专业（信息与资源方向）
是我国西部首个招收听力障碍学生的本科专业。该专业以培养具备特殊教育教师素养、特殊教育辅助技术相关专业知识和实践能力的高素质听力障碍人才为目标。该专业曾有全国首位聋人教授引领，小班化教学，有现代辅助技术和手语翻译课堂支持，有转入其它专业学习机会并提供融合支持。
3.教育康复学专业
以培养复合型教育康复人才为目标。自2009年开始，进行教育康复专业的探索与实践，组建了动作康复、沟通康复、心理康复、行为治疗、艺术治疗等多个专业学科团队，形成了较为完整的人才培养模式，该模式曾被中央电视台专题报道。该专业是国家重点发展与扶持的专业，发展潜力巨大。